Корень, развивающийся из корешка зародыша семени, называется главным корнем. Этот тип корня формируется непосредственно из зародышевого корешка, который является частью семени. Главный корень первым проникает в почву при прорастании семени и обеспечивает закрепление растения в почве, а также начинает процесс поглощения воды и минеральных веществ из почвы. С течением времени главный корень может давать начало боковым корням, формируя таким образом корневую систему растения.
Важно отметить, что у некоторых растений главный корень может быть очень выражен и глубоко уходить в почву, как, например, у моркови или свеклы, где он также выполняет функцию запасающего органа. В других случаях, как у многих злаков, главный корень со временем отмирает, и растение формирует мочковатую корневую систему, основанную на развитии придаточных корней.