Для того чтобы определить первичную структуру полипептида, необходимо сначала транскрибировать заданную последовательность ДНК в иРНК, а затем перевести последовательность иРНК в последовательность аминокислот.
Шаг 1: Транскрипция
Заданная последовательность ДНК: АЦААТААААГТТГ…
При транскрипции комплементарные пары нуклеотидов в иРНК следующие:
- А (аденин) комплементарен У (урацил) в иРНК
- Ц (цитозин) комплементарен Г (гуанин)
- Т (тимин) комплементарен А (аденин)
- Г (гуанин) комплементарен Ц (цитозин)
Таким образом, иРНК будет иметь следующую последовательность: УГУУАУУУУЦААЦ…
Шаг 2: Трансляция
Теперь мы должны разбить последовательность иРНК на кодоны (триплеты нуклеотидов) и перевести их в аминокислоты с помощью генетического кода:
- УГУ — Цистеин (Cys)
- УАУ — Тирозин (Tyr)
- УУУ — Фенилаланин (Phe)
- ЦАА — Глутамин (Gln)
- Ц… — Продолжаем, если последовательность известна
Таким образом, первоначальная последовательность аминокислот будет: Cys-Tyr-Phe-Gln…
Изменение нуклеотидов
Теперь рассмотрим ситуацию, когда 13-й и 2-й нуклеотиды поменялись местами. В исходной последовательности это будет выглядеть следующим образом:
- Исходная последовательность: АЦААТААААГТТГ…
- После замены: ААААТААААГТТГ…
Проведём те же шаги:
Новая транскрипция
- Новая последовательность иРНК: УУУУАУУУУЦААЦ…
Новая трансляция
- УУУ — Фенилаланин (Phe)
- УАУ — Тирозин (Tyr)
- УУУ — Фенилаланин (Phe)
- ЦАА — Глутамин (Gln)
Новая последовательность аминокислот будет: Phe-Tyr-Phe-Gln…
Итог
Замена 13-го и 2-го нуклеотидов привела к изменению первой аминокислоты в полипептиде с Цистеина (Cys) на Фенилаланин (Phe). Это изменение может значительно повлиять на структуру и функцию белка, так как аминокислоты имеют разные свойства и могут по-разному взаимодействовать с окружающими молекулами. Изменение даже одной аминокислоты может привести к изменению в сворачивании белка и, как следствие, к изменению его биологической активности или стабильности.