Для определения структуры участка ДНК, кодирующего данную полипептидную цепь, необходимо использовать генетический код, который позволяет связать конкретные аминокислоты с соответствующими триплетами нуклеотидов в ДНК.
Для данной последовательности аминокислот вал – ала – гли – лиз – три – вал – сер, кодонами будут являться:
- валин: GUA, GUU, GUC, GUG
- аланин: GCA, GCC, GCG, GCU
- глицин: GGA, GGC, GGG, GGU
- лизин: AAA, AAG
- треонин: ACA, ACC, ACG, ACU
- серин: AGC, AGU, UCA, UCC, UCG, UCU
Комбинируя эти кодоны, можно определить последовательность нуклеотидов в ДНК, кодирующую данную полипептидную цепь.
Для расчета массы участка ДНК необходимо учитывать массу каждого нуклеотида (A = 313 Da, T = 304 Da, G = 329 Da, C = 289 Da) и умножить на количество нуклеотидов в участке ДНК.
Длина участка ДНК будет зависеть от количества нуклеотидов, которые кодируют данную полипептидную цепь. Для точного определения длины участка ДНК необходимо знать точное количество кодонов, необходимых для синтеза полипептида.