Для того чтобы определить последовательность нуклеотидов ДНК, кодирующую данный полипептид, нам необходимо воспользоваться генетическим кодом, который определяет соответствие между триплетами нуклеотидов (кодонами) и аминокислотами.
Триплеты ДНК транскрибируются в комплементарные триплеты мРНК (кодоны), которые затем транслируются в аминокислоты.
Аминокислоты в составе белка:
- Три (Треонин) - Thr
- Мет (Метионин) - Met
- Три (Треонин) - Thr
- Тир (Тирозин) - Tyr
Кодоны мРНК для этих аминокислот:
- Треонин (Thr) - кодоны: ACU, ACC, ACA, ACG
- Метионин (Met) - кодон: AUG
- Тирозин (Tyr) - кодоны: UAU, UAC
Определим возможные последовательности кодонов мРНК для данного полипептида:
- Треонин: ACU, ACC, ACA, ACG
- Метионин: AUG
- Треонин: ACU, ACC, ACA, ACG
- Тирозин: UAU, UAC
Теперь построим последовательность мРНК для одной из возможных комбинаций:
- Thr (ACU) - Met (AUG) - Thr (ACU) - Tyr (UAU)
Последовательность мРНК: ACU AUG ACU UAU
Чтобы найти соответствующую последовательность ДНК, мы должны определить комплементарную последовательность на ДНК, которая служит матрицей для синтеза мРНК:
- мРНК: ACU AUG ACU UAU
- Комплементарная цепь ДНК (матрица): TGA TAC TGA ATA
Итак, последовательность нуклеотидов ДНК, кодирующая полипептид три-мет-три-тир, может быть представлена как:
5' TGA TAC TGA ATA 3'
Однако, поскольку ДНК двуцепочечная молекула, записанное выше - это последовательность одной цепи (матрицы). Для полноты, можем записать и другую цепь (кодирующую):
3' ACT ATG ACT ATA 5'
Эта цепь является комплементарной к мРНК и содержит кодоны, которые в процессе трансляции дадут нужные аминокислоты.