В данном случае мы имеем дело с мутацией, которая произошла в аллеле дикого типа. Чтобы определить вид мутации и её последствия, давайте сначала более подробно проанализируем последовательности.
Исходный аллель:
ЦЦЦГГТТАЦЦЦЦЦ ГГГЦЦАЦЦАТГГГГГ
Мутантный аллель:
ЦЦЦГГТАЦЦЦЦЦ ГГГЦЦАТГГГГГ
Анализ мутации:
Чтобы определить вид мутации, нужно сравнить обе последовательности и найти различие.
Исходный аллель:
ЦЦЦГГТТАЦЦЦЦЦ ГГГЦЦАЦЦАТГГГГГ
Мутантный аллель:
ЦЦЦГГТАЦЦЦЦЦ ГГГЦЦАТГГГГГ
Очевидно, что в мутантном аллеле отсутствует один нуклеотид "Т" в первом фрагменте. Это указывает на делецию (удаление) одного нуклеотида.
Определение вида мутации:
Это тип мутации называется точечной мутацией, конкретно делецией одного нуклеотида.
Влияние на аминокислотную последовательность:
Теперь давайте посмотрим, как эта делеция повлияет на аминокислотную последовательность полипептида. Для этого сначала переведём обе последовательности в кодоны (по три нуклеотида).
Исходный аллель:
ЦЦЦ ГГТ ТАЦ ЦЦЦ ЦЦЦ ГГГ ЦЦА ЦЦА ТГГ ГГГ
Мутантный аллель:
ЦЦЦ ГГТ АЦЦ ЦЦЦ ЦЦГ ГГГ ЦЦА ТГГ ГГГ
Затем переведём кодоны в аминокислоты с использованием генетического кода:
Исходный аллель:
ЦЦЦ - Pro (Пролин)
ГГТ - Gly (Глицин)
ТАЦ - Tyr (Тирозин)
ЦЦЦ - Pro (Пролин)
ЦЦЦ - Pro (Пролин)
ГГГ - Gly (Глицин)
ЦЦА - Pro (Пролин)
ЦЦА - Pro (Пролин)
ТГГ - Trp (Триптофан)
ГГГ - Gly (Глицин)
Мутантный аллель:
ЦЦЦ - Pro (Пролин)
ГГТ - Gly (Глицин)
АЦЦ - Thr (Треонин)
ЦЦЦ - Pro (Пролин)
ЦЦГ - Pro (Пролин)
ГГГ - Gly (Глицин)
ЦЦА - Pro (Пролин)
ТГГ - Trp (Триптофан)
ГГГ - Gly (Глицин)
Сравнение полипептидов:
Исходная аминокислотная последовательность:
Pro - Gly - Tyr - Pro - Pro - Gly - Pro - Pro - Trp - Gly
Мутантная аминокислотная последовательность:
Pro - Gly - Thr - Pro - Pro - Gly - Pro - Trp - Gly
Фенотипические проявления:
Мутация привела к смещению рамки считывания, что изменило все последующие кодоны и, соответственно, аминокислоты, которые они кодируют.
Смена аминокислот: В нормальной последовательности третий аминокислотный остаток — тирозин (Tyr), а в мутантной — треонин (Thr). Это может сильно изменить структурные и функциональные свойства белка.
Смещение рамки считывания: Делеция одного нуклеотида привела к смещению рамки считывания, что изменило всю последующую аминокислотную последовательность.
Функциональные последствия: В результате белок может потерять свою функцию или приобрести новую, что может проявиться на фенотипическом уровне по-разному:
- Если белок является структурным, это может привести к изменениям в тканях.
- Если белок является ферментом, это может нарушить метаболические пути.
- Если белок является сигнальным, это может повлиять на клеточную коммуникацию.
Заключение:
Исходная мутация — это делеция одного нуклеотида, которая привела к смещению рамки считывания и изменению аминокислотной последовательности полипептида. Фенотипические проявления этой мутации могут быть разнообразными, в зависимости от функции белка, кодируемого этим геном.